黑龍江省共有19所二本大學參與了2016黑龍江二本大學排名，其中排名第一的是哈爾濱理工大學，排名第二的是哈爾濱師范大學，排名第三的是東北石油大學，排名前10的大學還有黑龍江中醫藥大學、哈爾濱商業大學、齊齊哈爾大學、黑龍江科技大學、黑龍江八一農墾大學、佳木斯大學、黑龍江工程學院，以下是黑龍江二本大學排名2016具體榜單：
| 黑龍江二本大學排名 | 全國排名 | 學校名稱 | 學校類型 |
| 1 | 167 | 哈爾濱理工大學 | 理工 |
| 2 | 181 | 哈爾濱師范大學 | 師范 |
| 3 | 184 | 東北石油大學 | 理工 |
| 4 | 235 | 黑龍江中醫藥大學 | 醫藥 |
| 5 | 275 | 哈爾濱商業大學 | 財經 |
| 6 | 325 | 齊齊哈爾大學 | 綜合 |
| 7 | 355 | 黑龍江科技大學 | 理工 |
| 8 | 355 | 黑龍江八一農墾大學 | 農林 |
| 9 | 372 | 佳木斯大學 | 綜合 |
| 10 | 381 | 黑龍江工程學院 | 理工 |
| 11 | 489 | 牡丹江師范學院 | 師范 |
| 12 | 506 | 牡丹江醫學院 | 醫藥 |
| 13 | 521 | 綏化學院 | 綜合 |
| 14 | 525 | 哈爾濱金融學院 | 財經 |
| 15 | 583 | 黑河學院 | 綜合 |
| 16 | 592 | 哈爾濱學院 | 綜合 |
| 17 | 592 | 黑龍江工業學院 | 理工 |
| 18 | 601 | 齊齊哈爾醫學院 | 醫藥 |
| 19 | 615 | 大慶師范學院 | 師范 |
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