黑龍江省共有22所二本大學參與了2016黑龍江二本大學排名，其中排名第一的是哈爾濱商業大學，排名第二的是哈爾濱理工大學，排名第三的是黑龍江大學
以下是黑龍江二本大學排名2016具體榜單，根據2015年理科二本錄取均分排名，包含部分專業在二本招生的一本大學。
2016黑龍江二本大學排名
| 黑龍江二本大學排名 | 學校名稱 | 錄取線差 | 分數線 | 錄取均分 |
| 1 | 哈爾濱商業大學 | 96 | 371(第二批) | 467 |
| 2 | 哈爾濱理工大學 | 96 | 371(第二批) | 467 |
| 3 | 黑龍江大學 | 94 | 371(第二批) | 465 |
| 4 | 黑龍江中醫藥大學 | 90 | 371(第二批) | 461 |
| 5 | 哈爾濱師范大學 | 89 | 371(第二批) | 460 |
| 6 | 哈爾濱金融學院 | 88 | 371(第二批) | 459 |
| 7 | 哈爾濱醫科大學 | 81 | 371(第二批) | 452 |
| 8 | 牡丹江醫學院 | 78 | 371(第二批) | 449 |
| 9 | 齊齊哈爾醫學院 | 72 | 371(第二批) | 443 |
| 10 | 黑龍江科技大學 | 71 | 371(第二批) | 442 |
| 11 | 黑龍江工程學院 | 70 | 371(第二批) | 441 |
| 12 | 黑龍江八一農墾大學 | 58 | 371(第二批) | 429 |
| 13 | 齊齊哈爾大學 | 56 | 371(第二批) | 427 |
| 14 | 哈爾濱學院 | 56 | 371(第二批) | 427 |
| 15 | 佳木斯大學 | 54 | 371(第二批) | 425 |
| 16 | 牡丹江師范學院 | 43 | 371(第二批) | 414 |
| 17 | 大慶師范學院 | 36 | 371(第二批) | 407 |
| 18 | 黑龍江工業學院 | 35 | 371(第二批) | 406 |
| 19 | 綏化學院 | 30 | 371(第二批) | 401 |
| 20 | 黑河學院 | 27 | 371(第二批) | 398 |
| 21 | 黑龍江東方學院 | 25 | 371(第二批) | 396 |
| 22 | 哈爾濱體育學院 | 23 | 371(第二批) | 394 |
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