玉溪農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院的前身是國(guó)家級(jí)重點(diǎn)中專??玉溪農(nóng)業(yè)學(xué)校，成立于1956年，1991年經(jīng)省教委評(píng)估為合格中專學(xué)校，1993年被省政府認(rèn)定為省部級(jí)重點(diǎn)中專學(xué)校，2000年首批步入國(guó)家級(jí)重點(diǎn)中專的行列。

2002年3月22日，經(jīng)云南省人民政府批準(zhǔn)、教育部備案，獨(dú)立升格為以舉辦高等職業(yè)教育為主的、面向全國(guó)招生的全日制公辦高等職業(yè)學(xué)院。玉溪農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院目前已經(jīng)形成以專科層次全日制高職教育為主，普通專科、成人本（專）科、普通中專、短期培訓(xùn)等為輔的多層次、多渠道、多形式的辦學(xué)格局。學(xué)校遵循現(xiàn)代職業(yè)教育發(fā)展的教育教學(xué)規(guī)律，以立德樹人為根本、以服務(wù)發(fā)展為宗旨、以促進(jìn)就業(yè)為導(dǎo)向、以技術(shù)培養(yǎng)、以能力建設(shè)為重點(diǎn)，實(shí)施“六合”模式（工學(xué)結(jié)合、教練融合、校企聯(lián)合、校企合作、院院合作、院校合作），突出“三性三實(shí)”（突出實(shí)踐性、開放性和職業(yè)性；突出實(shí)驗(yàn)、實(shí)訓(xùn)、實(shí)）；采用“學(xué)院＋企業(yè)＋基地”，“學(xué)院＋企業(yè)＋基地＋客戶”，“學(xué)院＋科研所＋基地”等的辦學(xué)模式；建設(shè)好兩個(gè)基地，即“高級(jí)應(yīng)用型技術(shù)技能人才培養(yǎng)基地”、“農(nóng)業(yè)科技研究和新技術(shù)推廣基地”，立足玉溪、服務(wù)云南、面向全國(guó)、拓展東南亞、辦人民滿意的教育，為云南現(xiàn)代高等職業(yè)教育和玉溪經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展做貢獻(xiàn)。在60年的辦學(xué)歷程中，教育教學(xué)改革方面卓有成效，為社會(huì)培養(yǎng)出了3萬多名高素質(zhì)的現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技帶頭人和技能型人才，深受社會(huì)各界和用人單位好評(píng)。2012年，學(xué)院順利通過國(guó)家教育部人才培養(yǎng)工作的評(píng)估。

學(xué)院占地300余畝，擁有48個(gè)校內(nèi)實(shí)訓(xùn)實(shí)驗(yàn)室、2個(gè)校內(nèi)農(nóng)場(chǎng)、1個(gè)養(yǎng)殖場(chǎng)，49個(gè)校外實(shí)訓(xùn)基地，多媒體教室48間，座位數(shù)3184個(gè)。教學(xué)行政用房3.3萬方米，教學(xué)科研儀器設(shè)備1427.2萬元，圖書館藏書37.2萬冊(cè)，其中電子圖書20萬冊(cè)，學(xué)生宿舍2.7萬方米。

學(xué)院下設(shè)農(nóng)林科學(xué)系、信息技術(shù)與電氣工程系、經(jīng)濟(jì)管理系、動(dòng)物科學(xué)系、建筑與環(huán)境藝術(shù)工程系、食品藥品工程系，全日制在校專科生3711人，各類中短期培訓(xùn)在2700人次/年；學(xué)院有教職工246人，其中專任教師148人，校內(nèi)兼職教師59人，具有正高職稱5人，副高職稱61人，中級(jí)職稱98人，博士、碩士學(xué)位88人，雙學(xué)位1人，“雙師素質(zhì)”教師113人；省級(jí)教學(xué)名師2人，省級(jí)教學(xué)團(tuán)隊(duì)2個(gè)；國(guó)家級(jí)心理咨詢師9人。

2008年煙草栽培技術(shù)專業(yè)校外實(shí)訓(xùn)基地建設(shè)成為了省級(jí)示范性實(shí)訓(xùn)教學(xué)基地。2009年畜牧獸醫(yī)專業(yè)校外實(shí)訓(xùn)基地建設(shè)成為了省級(jí)示范性實(shí)訓(xùn)教學(xué)基地。2010年，學(xué)院被云南省高職高專學(xué)會(huì)評(píng)為“云南省職業(yè)教育先進(jìn)集體”。2012年煙草栽培技術(shù)專業(yè)獲中央財(cái)政“支持高等職業(yè)學(xué)校提升專業(yè)服務(wù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展能力”項(xiàng)目支持。

2012年，被云南省教育廳評(píng)為“云南省高等學(xué)校教學(xué)管理工作先進(jìn)集體”。

2012年，煙草栽培技術(shù)專業(yè)獲中央財(cái)政“高等職業(yè)學(xué)校提升專業(yè)服務(wù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展能力”項(xiàng)目支持；2013年該項(xiàng)目通過中期驗(yàn)收，其專業(yè)建設(shè)案例被遴選為教育部“高等職業(yè)學(xué)校提升專業(yè)服務(wù)產(chǎn)業(yè)能力”建設(shè)項(xiàng)目典型案例在全國(guó)進(jìn)行推廣。

2013年學(xué)院成功申報(bào)為“云南省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)培訓(xùn)基地”；同年，云南省第110職業(yè)技能鑒定所榮獲“云南省2013年度職業(yè)技能鑒定所先進(jìn)單位”稱號(hào)。

年來年學(xué)院加大對(duì)外交流活動(dòng)力度，面向南亞、東南亞10國(guó)舉辦了農(nóng)業(yè)技術(shù)國(guó)際培訓(xùn)班；加入了中國(guó)食品藥品職業(yè)教育聯(lián)盟，與江蘇食品藥品職業(yè)技術(shù)學(xué)院簽訂校際合作協(xié)議，并派出學(xué)生進(jìn)行學(xué)習(xí)交流；與臺(tái)灣環(huán)球科技大學(xué)、臺(tái)灣國(guó)立屏東商業(yè)技術(shù)學(xué)院、臺(tái)灣屏東科技大學(xué)建立合作意向等。