齊齊哈爾工程學院的前身，是成立于1958年的齊齊哈爾第一機床廠重型機床制造學院，文革前實施六年制（業余）本科和四年制(業余)專科教育，其間易名為齊齊哈爾第一機床廠“七?二一”工人大學、齊齊哈爾第一機床廠職工機電學院。
1993年，學校為支持國有企業公司化改造與企業簽訂經濟分離合同，成為全國第一家國企學校與企業分離的典型,易名為黑龍江東亞大學。2001年，省政府批準在黑龍江東亞大學基礎上成立齊齊哈爾職業學院，結束了齊齊哈爾市沒有地方普通高校的歷史。2011年4月，教育部批準齊齊哈爾職業學院升格更名為齊齊哈爾工程學院，學院屬本科層次的普通高校，隸屬齊齊哈爾市人民政府。
學院現有三個校區，全日制在校生逾萬人，開設工學、管理學、文學、農學、法學5個學科門類的40多個專業，基本形成了以工學為主，管理學、文學、農學、法學為輔，以機械設計制造及自動化、汽車服務工程、土木工程等專業為，工、管、文、農、法等多學科協調發展的辦學格局，下設機電工程系、交通工程系、信息工程系、建筑工程系、管理工程系、附屬建華醫院、附屬三亞城市職業學院及附屬高級技工學校、職業高中。
學院積極探索“政校企合作、產學研一體、教學做合一”辦學模式，堅持“開一個專業，辦一個實體，興一份產業，創一個品牌”的專業建設原則，依托專業創辦了齊三機床有限公司、汽車教學中心（汽車博覽中心）、家政教學中心（百草家園老年公寓）、機電設備有限公司、二手車交易市場、汽車駕駛員培訓學校等21個專業實體，覆蓋了學院所開設的40多個專業。
學院所創的學校“委托管理”模式已寫入《國家教育中長期發展綱要》的第42條和第67條中；學院教育改革實踐已成為了國家教育行政學院的教學案例，院長曹勇安教授連續15年受聘國家教育行政學院。教師編著、出版了106本教材；獲得省級以上優秀論文獎和優秀科技成果獎189次，在國家級、省級雜志上發表學術論文467篇，參與《<職教法>修訂的實證研究》、《做強高等職業教育》等國家級重點課題研究，承擔省級以上課題94項。
學院堅持以學生發展為主線開展教育教學活動，實施全程化職業生涯教育，是全國職業生涯教育典型院校。學院畢業生以其基礎扎實、特長明顯深受用人單位的歡迎，經黑龍江省教育廳核定,我院連續五年畢業生就業率位居全省同類院校前列。學院系教育部人才培養工作水評估優秀學校、黑龍江省高校就業工作先進集體。
學院的發展業績引起了國家、政府和社會各界的關注。成思危、周鐵農、彭?云等*曾蒞臨視察指導；人民日報、光明日報、中國教育報、香港“大公報”、新華社內參等媒體介紹了學院辦學經驗，院長曹勇安先后應邀赴比利時和美國，在中比教育論壇和中美教育發展論壇上做主旨報告，受到了業內的好評。
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